一、服務(wù)介紹
microRNA(miRNA)是一種大小約21—23個(gè)堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個(gè)堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(雙鏈)但是和siRNA密切相關(guān)。microRNA通過和靶基因mRNA堿基配對(duì)引導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的**,從而在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控蛋白表達(dá)(新發(fā)現(xiàn)miRNA也能在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá))。miRNA在物種進(jìn)化中相當(dāng)保守,在動(dòng)物、植物和**等中發(fā)現(xiàn)的miRNA表達(dá)均有嚴(yán)格的組織特異性和時(shí)序性。miRNA在細(xì)胞生長(zhǎng)和發(fā)育過程中起多種作用,包括調(diào)控發(fā)育、分化、凋亡和增殖等。
目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技術(shù)以及**代測(cè)序技術(shù)。基于**代測(cè)序技術(shù)的miRNA測(cè)序,可以一次獲得數(shù)百萬條miRNA序列,能夠快速鑒定出不同組織、不同發(fā)育階段、不同**狀態(tài)下已知和未知的miRNA及其表達(dá)差異,為研究miRNA對(duì)細(xì)胞進(jìn)程的作用及其生物學(xué)影響提供了有力工具。
二、分析項(xiàng)目
標(biāo)準(zhǔn)分析項(xiàng)目
1) 原始數(shù)據(jù)質(zhì)控(去接頭污染,去低質(zhì)量reads),數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì);
2) 與參考序列比對(duì);
3) 小RNA與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、piRNA的比對(duì)信息;
4) 小RNA與miRBase 中指定范圍的已知的 miRNA的比對(duì);
5) 按照優(yōu)先級(jí)將小RNA進(jìn)行分類注釋;
6) 預(yù)測(cè)新的miRNA;
7) 差異miRNA分析;
8) 差異miRNA表達(dá)聚類分析;
9) miRNA靶基因預(yù)測(cè)分析
10) 靶基因功能富集分析
上等分析項(xiàng)目(以下分析選擇分析結(jié)果較好的3~5個(gè))
靶基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA功能協(xié)同網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA通路協(xié)同網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA共調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
miRNA活性分析
按照客戶要求對(duì)興趣miRNA進(jìn)行深入分析;
重要miRNA的功能富集分析;
三、樣本要求
RNA樣品總量: ≥3μg
RNA樣品濃度: ≥200 ng/μL
四、項(xiàng)目周期
45個(gè)工作日